毕业于华南农业大学作物遗传育种专业，获博士学位。

1990年7月在华南农业大学农学院参加工作，历任助教、助理研究员、副教授、教授。

其间：2002年赴俄罗斯莫斯科季米亚捷夫农业大学做访问学者。

曾任华南农业大学科技处副处长兼新农村建设服务中心主任、重点实验室建设办公室主任，

曾挂任广东省阳东县副县长及广西农业厅厅长助理。

2012年6月至2015年6月任民进广东省委秘书长。

2015年6月至2019年10月任仲恺农业工程学院副院长

2017年6月任民进广东省委副主委

2019年10月任广州大学副校长。

第十三届全国人民代表大会代表，广东省政协委员，广州市人大代表；中国玉米专业委员鲜食玉米分会副会长。

2017年6月11-12日，中国民主促进会广东省第八次代表大会，李小琴当选为副主任委员。

2019年10月，广东省政府免去： 李小琴仲恺农业工程学院副院长职务。

2019年10月30日，广州市人民政府批准：任命李小琴为广州大学副校长。

①．甜玉米新品种“超甜43”，1994.11通过广东省品种审定.第4完**.

②．甜玉米新品种“农甜1号”，2000.3通过广东省品种审定.第1完**.

③．甜玉米新品种“农甜2号”，2004.3通过广东省品种审定. 第1完**.

④．甜玉米新品种“农甜3号”，2004.10通过国家品种审定. 第1完**.

⑤．1994.12,选育甜玉米新品种“超甜43”,获“农业部科技进步三等奖”。

⑥．2002．12，获中国教育部与霍英东教育基金会颁发的“青年教师三等奖”。

⑦．2004．8，因“甜玉米新品种农甜1号的推广”成效显著 ，获“广东省农业技术推广二等奖”。

⑧．2004．6，获华南农业大学颁发的“教学观摩二等奖”。

⑨．2001．4，被华南农业大学评为“科技推广先进工作者”

1.李小琴，万邦惠，刘纪麟等，(2004) 玉米新不育胞质WB的线粒体类质粒鉴定．华南农业大学学报，25：118-1192. 李小琴，万邦惠，刘纪麟等，(2004) 玉米新不育胞质WBMs小孢子败育的细胞学观察．中国农业科学，37：1261-12643. 李小琴，万邦惠，刘纪麟等，玉米细胞质线粒体DNA RFLP分类研究.作物学报，2001，27（4）：476-4814. 李小琴和吴景强，(2002) 我国甜玉米育种概况及面临的挑战．作物杂志，45-465. 周淑梅，李小琴，孙秀东，(2008) 甜玉米子粒果皮厚度变化规律的研究．作物杂志，17-206. 张士龙，周淑梅，王青峰，李小琴，(2008) 玉米籽粒果皮厚度变化规律研究．华南农业大学学报，10-13研究项目：1. 优质高产甜玉米新品种选育与加工技术研究课题主持人, 2006A20203003 2006-2010省攻关2. 优质抗逆抗病甜、糯玉米新品种选育与产业化推进课题主持人, 2007A020400002 2007-2010 省攻关3. 优质耐热型甜玉米新品种选育与示范课题主持人, 2006-2008 广东省农业厅4. 优质甜玉米循环产业示范与推广课题主持人, 2007BAD89B14 2008-2011 国家支撑计划子课题5. 优质甜玉米种质资源引进利用与品质遗传课题主持人, 2008B050100046 2008-2011 省攻关6. 特用玉米育种攻关课题主持人, 2009-2010 省农业厅7. 高产型甜玉米的选育课题主持人, 2009-2010 省农业厅8. 甜玉米维生素E基因QTL定位研究课题主持人, 31071427 2011-2013 国家自然科学基金9. 高品质甜玉米种质资源引进利用与研究课题主持人, 2010.11-2011.12 广东省农业厅